OpenEye部署Orion分子设计平台,寻找COVID-19疗法;将结果免费提供

发布的 188金宝慱官网送1882020年4月27日

COVID-19视图2

SARS-CoV-2 Mpro蛋白酶和我们对接研究中得分前三的。这三个化合物是从Enamine REAL文库中筛选出的约14亿个可合成化合物。的这个对接研究的前10,000个点击量可以免费下载。

简介:为了快速找到COVID-19的潜在疗法,OpenEye完成了多项大规模计算研究。在这里,我们发表了第一组这样的结果,并让他们免费提供,以推进对治疗的研究。

当前的COVID-19疾病大流行是由一种被称为SARS-CoV-2的病毒感染的冠状病毒引起的。冠状病毒的治疗一直难以捉摸,目前正在进行临床试验,试图找出治疗这种感染的化合物。靶向病毒酶的功能已经被证明是治疗病毒感染的一种成功的方法。有几种酶通常在病毒基因组中被利用,其中一种,病毒成熟蛋白酶一直是开发抗病毒疗法的重点。

在Op188金宝慱官网送188enEye Scientific,我们对通过分子对接来发现药物先导物有长期的兴趣,利用目标蛋白的三维结构来识别大型类药物分子库中的先导化合物。最近,我们已经将这种对接方法扩展到数十亿个易于合成的化合物的大型库中。其中一个名为Enamine REAL的文库已成功用于对接实验,以识别各种靶标中的新化学物质。截至2020年4月,Enamine REAL库由大约14亿分子组成,如果在三维恰当地枚举。

我们使用了Liu发表的SARS-CoV-2蛋白酶的x射线晶体结构,.(PDB接入号6LU7)。利用这种结构,我们进行了对接研究,以确定蛋白酶抑制剂的潜在先导物。该计算使用了50,000个cpu,由OpenEye的Orion分子设计平台支持,该平台由Amazon Web Services (AWS)提供支持。这项计算涉及将2660亿个小分子结构对接到蛋白质靶点,需要3.5天完成,并得到了AWS的慷慨资助。作为一种服务新型冠状病毒肺炎在治疗发展方面,我们提供免费的计算结果,让全世界的研究人员能够测试这些潜在的治疗方法。此外,我们正在寻求与研究人员联系,以合作进一步检测COVID-19蛋白靶点和分子。请电子邮件info@eyesopen.com获取详细信息。

可供公众使用的资料:

射击,得分,姿势和Enamine化合物id

6LU7蛋白晶体结构准备对接

这项工作得到了Amazon Web Services的慷慨资助。

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