自定义编码

    OpenEye的自定义编码

    OpenEye的自定义编码

    OpenEye的建模应用程序都是使用OpenEye也提供给客户的尖端化学信息学和科学工具包构建的;例如,我们的类领先的形状比较和评分工具188app彩票 是建立在TK形状.长期以来,我们的工具包为用户提供了一种解决方案,用户可以在应用程序中获得对计算方法和结果的更多控制。然而,我们相信工具包的最终价值不在于它们的单独使用,而在于它们的集成,以产生定制的解决方案,从多个工具包中提取功能的子集,并将它们组合起来解决独特的问题。我们在开发成功的铅跳应用程序时采用了这种方法EON它通过形状和静电学上的相似性来识别新化合物。EON结合使用OEChem TK(cheminformatics),ωTK(构象异构体抽样),TK形状(形状得分)Zap TK(静电计分)达到这一目的。

    我们发现工具包的适当组合在解决我们自己的开发工作中的问题方面非常有价值,我们现在通过Toolkit应用程序组向我们的客户提供这种功能。我们的客户的问题是独一无二的,因此我们的目标是针对这些独特的问题开发独立的解决方案。188BET有苹果版吗最近的一些自定义编码小组和我们的客户之间合作的例子已经解决了几个不同规模的问题:

    • 开发一种自定义指纹方法。

    • Binding site matching, alignment, and display:使用组合TK形状Spicoli TKOEChem TK蛋白质结合位点用来对不同的蛋白质进行比对和评分。

    • 匹配分子对识别和分析:使用OEMedChem TK 2D描述工具包输出的匹配分子对OEDepict TK用于突出显示转换并显示与之相关的数据。

    • 形状多样化库的设计:根据形状多样化从化合物的大型库中选择子集OEChem形状谢谢

    获取更多详细信息定制可能适合您,请通过以下链接与我们联系:


    自定义代码的支持

    修改FastROCS

    该图像说明了我们如何为我们的一个客户修改FastROCS服务器。我们实现了一个工作流,其中计算每个分子与所有其他结构的3D相似值,而不是使用一个查询分子来筛选数据库中的类似化合物。这使得用户能够创建一个相似矩阵,用于识别高度相似/不同结构的集群。

    Baidu