数据库准备

数据库准备

数据库准备

为了搜索大型化合物数据库以寻找新的生物活性分子,需要适当地制备化合物数据库。OpenEye提供了一组工具来解决此任务的各个方面。

筛选

快速除去具有不希望的物理化学或图形性质的化合物,进一步进一步,更耗时,任务。提供用于药物的预先产生的过滤器,并且可以为自己的目的容易地产生自定义过滤器。

Quacpac.

如果配体结构是来自PDB,您自己的公司数据库或供应商数据库,QuacPAC有助于对其离子状态的良好判断,其互变异构体状态以及适用于求解或力场基础的求解的该状态的部分收费。QUACPAC允许快速估计可能的离子和互变异构体状态,建议使用中性pH值周围的优选状态,并使用一组不同的模型从基于快速,一致的图形的方法的不同模型来提供适用于您的建模需求的部分收费。方法。

欧米茄

用于各种下游任务的类领先的构象生成,包括形状匹配和对准(ROCS和Subrocs),对接(OEDocking)和熵计算(SZYBKI)。OMEGA为用户提供了灵活而强大的控制,对构象生成的所有重要方面,允许精度,集合尺寸和速度的最佳组合。

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数据库准备技术。

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