数据库准备

数据库准备

数据库准备

为了在大型的化合物数据库中查找新的生物活性分子,需要适当地编制化合物数据库。OpenEye提供了一组工具来处理这个任务的各个方面。

过滤器

快速去除化合物,有不良的物理化学或图形性质之前,进一步,更费时的任务。预先生成的过滤器类药物和类铅分子提供,用户可以很容易地生成自定义过滤器为自己的目的。

QUACPAC

无论配体结构来自PDB,您自己的公司数据库,或供应商数据库,QUACPAC有助于良好的判断其离子态,其互变异构态,以及在溶剂化或基于力场的建模中,哪个部分电荷适用于该状态。QUACPAC允许快速估计可能的离子和互变异体状态,建议中性pH周围的优先状态,并提供针对您的建模需求的部分电荷,使用一组不同的模型,从快速、一致的基于图的方法到更物理准确的半经验方法。

ω

为广泛的下游任务,包括形状匹配和对齐(ROCS和subROCS),对接(OEDocking)和熵计算(SZYBKI)等类领先的构像生成。OMEGA为用户提供了对构造生成的所有重要方面的灵活和强大的控制,从而实现精度、整体尺寸和速度的最佳组合。

欲知更详细的资料数据库准备产品,请参阅以下连结:

文档 > 评估
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数据库技术做准备。

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