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过滤器

过滤器

复合性质的计算和不可取之处的去除

过滤器是非常快的分子过滤与选择应用程序。它结合了物理性质计算和功能群知识消除不良的化合物在他们进入实验或虚拟筛选之前。

不良特性可能包括:毒性功能,与目标蛋白共价结合的可能性高,干扰实验测定,和/或口服生物利用度的可能性低。

反过来,在使用建模应用程序之前消除不需要的分子将会大大增加提高阳性预测值大大减少了它们的处理时间。

有关过滤器的详细资料,请按以下连结:


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尽早去除不需要的化合物可以显著提高下游工艺的效率;这是一个经常被忽视的简单概念。

特性

  • 使用预定义的过滤器文件-文本文件,可以很容易地定制
  • 过滤器基于计算的性质,如:MW, XlogP [1], xlog, PSA[2],氢键供体和受体计数,可旋转键,环的大小和数量等。
  • 删除或保留基于预定义或用户定义的子结构的分子
  • 为一致性和速度指定基于图的质子态
  • 提供ADME滤波器,如Lipinski [3], Egan [4], Veber[5]和Martin [6]
  • 移除不可能键合和不合适元素的化合物
  • 生成适合导入到电子表格的选项卡分离的文件
  • 流程400摩尔/秒

参考文献

  1. 一种新的计算分配系数的原子加性方法王锐,英芳,赖莉,j .化学。正无穷。第一版。科学。199737, 615年。
  2. 快速计算分子极性表面积作为基于碎片的贡献的总和及其在药物运输性质预测中的应用埃特尔,P.罗德,B.塞尔泽,P.塞尔泽,j .地中海,化学。200043, 3714年。
  3. 在药物发现和开发环境中估计溶解度和渗透性的实验和计算方法李平斯基等,药物Deliv放置。牧师。1997233。
  4. 多变量统计预测药物吸收伊根,w.j.,默茨,k.m.,鲍德温,j.j.,j .地中海,化学。200043, 3867年。
  5. 影响候选药物口服生物利用度的分子特性D.F Veber,约翰逊,S.R Cheng H.Y。史密斯,B.R。沃德,K.W, Kipple, K.D。j .地中海,化学。200245, 2615年。
  6. 生物利用度分值马丁,Y.C。,j .地中海,化学。200548, 3164年。
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