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高效和选择性分子的设计需要使用各种各样的技术和方法。OpenEye提供188BET有苹果版吗基于“前沿科学”的先导优188金宝账号上不去怎么回事化问题。

提出了预测

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准确可靠的蛋白质结合位点姿势。使用的关键优势188app金宝搏网页登录 返回的姿势不仅会被评分,还会被注释为姿势是正确的信心或概率。这允许基于POSIT的预测更明智地应用资源(分析、合成、购买)。

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在缺乏蛋白质结构的情况下,ROCS在高精度亚ROCS模式下提供了有用的分子排列和定位预测。子ROCS对相互对齐的详尽探索提供了比在标准、高吞吐量模式下从ROCS获得的更精确的对齐。

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脚手架跳跃

新分子类的发现有两种途径:

EON

利用形状和静电相似性进行整体分子置换。物理上真实的静电势比较允许识别生物活性分子与现有的已知活性分子有本质不同的结构。

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苦思冥想的

片段替换。在ROCS和EON中用于整个分子比较的形状和静电相似性的精确估计,在BROOD中用于对候选片段进行评分和排序,以替代生物活性分子的选定部分(核心或侧链)。BROOD还可以提出连接小分子和环化的片段假设。

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亲和力优化

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基于水能量学的效能优化假设。在配体附近的蛋白质结合位点上,通过对配体进行简单的化学修饰,可以快速而严格地计算水的能量。通过对水稳定性的焓和熵贡献的理解,这为分子支架的操作或添加/扩展提供了易于解释的建议,以提高结合亲和力。

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带来稳定

自由的

对分子构象自由能的快速而可靠的估计。理解计算出的分子姿态或构象的稳定性是两个重要问题的核心;姿势的重新评分和比较关于减少构象灵活性的假设。自由形式计算焓和熵的贡献,构成稳定,从而提供了可测试的假设,对硬化或环化的影响,铅分子的结合亲和。

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图1:Freeform可以用来回答关于僵化或环化假说的可行性问题;合成环状或刚性类似物所需要的化学努力是否可能导致药效的提高?
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