AFITT特色出版物
P. A.雅诺夫斯基，N. W.莫里亚蒂，B. P.凯利，D. A. Case, D. M. York, P. D. Adams, G. L. Warren，“改进的配体几何在晶体细化使用AFITT在凤凰”，Acta结晶。，2016，D72, 1062 - 1072页
S. Wlodek, A. g . Skillman和A. Nicholls，“结合力场和形状势的配体自动放置和细化”，Acta结晶。，2006，D62 (7),页741 - 749
EON以出版物
洛佩斯-拉莫斯先生和佩鲁乔先生，HPPD:基于配体和靶标的除草剂靶标虚拟筛选，j .化学。正无穷。模型。，2010，50 (5),页801 - 814
E. Naylor, A. Arredouani, S.R. Vasudevan, A.M.路易斯，R. Parkesh, A. Mizote, D. Rosen, J.M. Thomas, M. Izumi, A. Ganesan, A. Galione and G.C. Churchill，通过虚拟筛选鉴定NAADP的化学探针，化学生物学性质，2009，5,页220 - 226
M.I. Zavodsky, A. rohatkim, J.R. Van Voorst, H. Yan和L.E. Kuhn，基于结构的虚拟筛选中配体相似性评分，Recog j·摩尔。，2009，22日(4),页280 - 292
G. Tresadern, D. Bemporad和T. Howe，基于配体的虚拟筛选方法的比较及促肾上腺皮质激素释放因子1受体的应用，j·摩尔。图。和模型。，2009，27日(8),页860 - 870
P. Markt, R.K. Petersen, E.N Flindt, K. Kristiansen, J. Kirchmair, G. Spitzer, S. Distinito, D. Schuster, G. Wolber, C. Laggner and T. Langer，基于药效团建模、三维形状和静电相似筛选的虚拟筛选方法发现新型PPAR配体，j .地中海,化学。，2008，51 (20),页6303 - 6317
S.W. Muchmore, A.J. Souers和I. Akritopoulou-Zanze，三维形状和静电相似性搜索在黑色素浓缩激素受体1拮抗剂鉴定中的应用，化学生物学与药物设计，2006，67 (2),页174 - 176
OEDocking特色出版物
m .麦克甘标准化数据集上的FRED和混合对接性能，j . Comp.-Aid。摩尔。设计，2012，26,页897 - 906
m .麦克甘FRED姿势预测与虚拟筛选精度，j .化学。正无穷。模型。，2011，51 (3),页578 - 596
S.L. Swann, S.P. Brown, S.W. Muchmore, H. Patel, P. Merta, J. Locklear and P.J. Hajduk，基于结构和配体的虚拟筛选的统一概率框架，j .地中海,化学。，2011，54 (5),页1223 - 1232T。
Tuccinardi M. Botta A. Giordano和A. Martinelli，蛋白激酶:对接与同源建模的可靠性，j .化学。正无穷。模型。，2010，50 (6), 1432 - 1440。
A.J.S. Knox, T. Price, M. Pawlak, G. Golfis, C.T. Flood, D. Fayne, D.C. Williams, M.J. Meegan和D.G. Lloyd，结合配体和基于结构的虚拟筛选鉴定首个热休克蛋白90 (Hsp90)和微管蛋白双靶标剂，j .地中海,化学。，2009，52 (8),页2177 - 2180
G.B. mcgauhey, R.P. Sheridan, C.I. Bayly, J.C. Culberson, c.c reatsolas, S. Lindsley, V. Maiorov, j.f。Truchon和W.D.康奈尔，虚拟筛选中拓扑、形状和对接方法的比较，j .化学。正无穷。模型。，2007，47 (4),页1504 - 1519
mr . McGann, H.R. Almond, A. Nicholls, J.A. Grant and F.K. Brown，“高斯对接功能”，生物聚合物，2003，68 (1),页76 - 90
OEChem TK特色出版物
贝诺和兰利，MORPH:配体设计的新工具，j .化学。正无穷。模型。，2010，50 (6),页1159 - 1164
r·塞尔化学命名法的计算机外文翻译，j .化学。正无穷。模型。，2009，49 (3),页519 - 530
j·a·格兰特，j·a·黑格，B.T.皮卡，a·尼克尔斯和r·a·塞尔，语言、有限状态机和快速相似搜索，j .化学。正无穷。模型。，2006，46 (5),页1912 - 1918
j·j·欧文和b·k·肖希特，锌-用于虚拟筛选的免费商业可用化合物数据库，j .化学。正无穷。模型。，2005，45 (1),页177 - 182
ω为出版物
保罗·c·d·霍金斯和斯坦尼斯劳·弗洛德克自信的决策:在固体分子构象取样中的应用”。j .化学。正无穷。模型。2020，60 (7), 3518 - 3533页。
P.C.D. Hawkins和A. Nicholls， "基于OMEGA的共形生成:数据集的学习和故障分析”。j .化学。正无穷。模型。2012，52, 2919 - 2936页。
P.C.D.霍金斯、A.G.斯基尔曼、G.L.沃伦、B.A.埃林森和M.T.斯塔尔，基于OMEGA的构象生成:使用来自蛋白质数据库和剑桥结构数据库的高质量结构的算法和验证，j .化学。正无穷。模型。，2010，50 (4),页572 - 584
E. Perola和P.S. Charifson，类药物分子与蛋白质结合的构象分析:结合后配体重组的广泛研究，j .地中海,化学。，2004，47 (10),页2499 - 2510
中华民国特色的出版物
S.L. Swann, S.P. Brown, S.W. Muchmore, H. Patel, P. Merta, J. Locklear and P.J. Hajduk，基于结构和配体的虚拟筛选的统一概率框架，j .地中海,化学。，2011，54 (5),页1223 - 1232
S.W.马多、d.a Debe、J.T. Metz、S.P. Brown、Y.C. Martin和P.J. Hajduk，信念理论在相似数据融合中的应用，用于模拟搜索和跳线，j .化学。正无穷。模型。，2008，48 (5),页941 - 948
G.B. mcgauhey, R.P. Sheridan, C.I. Bayly, J.C. Culberson, c.c reatsolas, S. Lindsley, V. Maiorov, j.f。Truchon和W.D.康奈尔，虚拟筛选中拓扑、形状和对接方法的比较，j .化学。正无穷。模型。，2007，47 (4),页1504 - 1519
P.C.D.霍金斯，A.G.斯基尔曼和A.G.尼科尔斯，＂形状匹配与对接作为虚拟筛选工具的比较＂，j .地中海,化学。，2007，50 (1),页74 - 82
Zap TK特色出版物
j。m。Word和a。Nicholls，《Zap中高斯介质边界在蛋白质pKa值预测中的应用》，蛋白质:结构、功能和生物信息学，2011
s。p。布朗和s。w。蛋白质-配体结合亲和力的高通量计算:MM-PBSA协议对企业网格计算的修改和适应，j .化学。正无穷。模型。，2006，46 (3),页999 - 1005
N.V. Prabhu, P. Zhu和K.A. Sharp，用光滑介电常数有限差分泊松-玻尔兹曼方法实现和测试分子动力学中稳定、快速的隐式溶剂化，j . Comp。化学。，2004，25 (16),页2049 - 2064
G.E. Kellogg S. Phatak A. Nicholls和J.A. Grant，三维QSAR中泊松-玻尔兹曼静电势场的验证:基于多数据集的CoMFA研究，QSAR与组合科学，2004，22 (9 - 10),页959 - 964
j·a·格兰特，b·t·皮卡和a·a·尼科尔斯，Poisson-Boltzmann溶剂化方法的光滑介电常数函数，j . Comp。化学。，2001，22日(6),页608 - 640
SAMPL特色出版物
B.A. Ellingson, A.G. Skillman和A. Nicholls，《SM8和Zap TK计算及其几何灵敏度分析》，j .第一版。辅助摩尔,Des。，2010，24 (4),页335 - 342
a·g·斯基尔曼，m·t·格巴莱和a·尼科尔斯，《SAMPL2挑战:溶剂化能和互变异构比的预测》，j .第一版。辅助摩尔,Des。，2010，24 (4)259 - 279页
A. Nicholls, S. Wlodek和J.A. Grant，“SAMPL2与连续体建模”，j .第一版。辅助摩尔,Des。，2010，24 (4),页293 - 306
其他有特色的出版物
j。a。格兰特，b。t。皮卡，m。j。赛克斯，c。a。Kitchen和a。Nicholls，介电极化能的一个简单公式:谢菲尔德溶剂化模型，化学物理快报，2007，441 (1 - 3),页163 - 166
白皮书
本文介绍了一种基于配体的虚拟筛选方法，该方法基于一种描述分子形状和化学性质的新方法，具体体现在ROCS(化学结构快速覆盖)的应用中。综上所述,188app彩票
它的支持应用构成了一个有效的虚拟筛选工作流，能够处理几十万个分子，无论是在过程的处理和可视化阶段。