所有的蛋白质-配体结合作用都发生在水环境中，因此预测结合位点内溶剂分子的作用是理解结合亲和力的必要步骤。然而，蛋白质和配体与水分子的相互作用可能具有复杂而不明显的作用，这可能使水分子之间的相互作用变得复杂和模糊188app官网 活动。SZMAP是Openeye的应用，以帮助建模者和药用化学家了解水在分子相互作用如配体结合中的作用。使用水作为镜片，SZMAP可以向用户提供关于绑定部位的关键特征的识别，预测相邻水域如何影响配体的结合，或者产生配体修饰假设，该配体修饰假设旨在更好地利用在结合位点上的特定区域。SZMAP中使用的半连续体[1,2]方法将一个明确的水分子与鲁棒连续体溶剂方法[3]，经典统计力学和彻底的采样加上分析特定的水取向的能力。
集成到SZMAP中，是游戏机，基于近于感兴趣的植物配体的蛋白质结合位点的积分能量的能量学基于水分的独特方法。188188金宝搏 易于易于解释用于操纵分子支架或向该支架的添加/延伸的建议，以利用对焓和熵促进到水稳定性的理解来改善结合亲和力。
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SZMAP和GamePlan能够良好地利用多个处理器来速度计算单个计算机和计算机网络。在一个CPU与先前版本的SZMAP上的CPU上接近3小时，可以实现显着的加速。